长跑是一项全身性的运动，对全身各器官系统都能产生良好的影响：
使肺功能变强，增大肺活量——进行规律性的长期长跑可发达肺部呼吸肌，使每次换气量变大，肺功能好转。平常人换气量为60-120升/每分钟，经常长跑者为100-150升/每分钟。
促进血液循环使心脏、血管系统发达——平常人安静时的摄氧量为200-300毫升/每分钟，长跑时为3,000-5,000毫升/每分钟，长期长跑最大摄氧量能获得明显的改善，且心跳次数增加，增加由心脏送出的血液量，从而使输送到身体各个器官的氧量大大增加，各个器官的工作质量自然大大提高。另外长跑会加速血液循环，使冠状动脉有足够的血液供给心肌，从而预防各种心脏病。通过下肢的运动，促使静脉血倒流心脏，预防静脉内血栓形成。身体对长期长跑发生的适应性改变可改善新陈代谢,减低血脂和胆固醇水平，有利于控制体重。
增加肌肉的强度——长期长跑可增强肺部呼吸肌、心脏肌肉、颈部肌肉、胸腔肌肉、手臂肌及腰部、臀部、大腿、小腿、足部等处的肌肉，使各处肌肉不易堆积乳酸或二氧化碳等代谢物。
增加关节柔软度及强化骨骼——长期长跑可提高各关节的强度，韧带的柔软度;并增加骨骼的强度、密度，避免退化性骨质疏松。
长期的长跑对人的心理也会有较大的影响：
使人精神振奋，提高对抗压力的能力——长跑可起到调节大脑皮质兴奋和抑制的作用，提高神经系统的功能，消除脑力劳动的疲劳，预防神经衰弱。长跑时可制造出与「幸福感」有关的「脑啡」(Endorphins)，并且在压力出现时，身体自然释放出脑啡，减少心跳的次数，轻松处理来自各方面的压力。
增进创造力——长跑时，脑部的Beta波会渐渐消退，Alpha波增加有助于右脑直觉式思考，所释放出来的脑啡有助人集中精神，思考清晰，激发潜能而增进创造力。
信心大增——长跑时会影响自我独立概念，在不断喘气呼吸及汗流夹背时，较容易突破自我设限，可提升个人效率以及自尊感从而使人充满信心。
乐观进取——长跑是一种有氧运动，可促进血液中氧的浓度，因而增强体力，精神意志力集中，对人及事务的处理较积极乐观。
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